生殖器溃疡的原因很多，大致上可分为感染、外伤、肿瘤、过敏及不明原因等，其中最常见的是：因危险性行为传染梅毒螺旋体引起的梅毒、杜克立氏嗜血杆菌感染的软性下疳及单纯疱疹病毒感染的生殖器疱疹三种性传染病为主要原因。

　　当生殖器附近皮肤变红而且上面有成群疼痛的水泡时，就可能是感染了，整个发病过程约三周左右，由水泡期、溃疡期而结痂期，会搔痒、溃疡疼痛至结痂消失，以后会不定期再发，但过程会较初次感染减短、症状减轻。感染生殖器疱疹目前尚无适当的根治药物，对症状治疗防止合并症及再复发为治疗原则。适度的运动，均衡的饮食，正常的作息，不吃刺激性食物，不喝酒，不熬夜，可减少再复发的机会。发病时避免发生性行为。

　　初期梅毒开始是丘疹，不久即变为溃疡，单一病灶，其特征边缘整齐，圆形无痛性，边界及底部略深具弹性呈硬感，俗称硬性下疳；软性下疳出现溃疡之特征为边缘不规则，稍圆、具痛感，底部浅且软，故称软性下疳，多发性病灶。

　　除了采取病灶之渗出液检查梅毒螺旋体或格兰氏染色杜克立氏嗜血杆菌外，抽血检验梅毒血清反应可鉴别诊断梅毒或软性下疳。只要能早期发现，早期治疗，现在的医疗科技已能有效的治愈梅毒与软性下疳，二者都无免疫，如有危险性行为都会再度感染，所以要做好安全性行为，固定单一性伴侣，全程使用保险套。